2020年在香港检测到Covid-19患者的尖峰蛋白监测

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J Med Virol。2021年5月5日。DOI:10.1002 / JMV.27063。在线之前在线。

抽象的

背景:在2020年,报告了许多快速蔓延的SARS-COV-2变体。这些变体在穗蛋白质中具有异常高的遗传变化。

目的:在疫苗接种前,试图了解香港SARS-COV-2病毒的遗传背景,本研究的目的是总结2020年香港Covid-19患者中检测到的S蛋白质突变。

研究设计:2020年每月选取COVID-19病例。对每个病例的一种病毒进行分析。对S蛋白的全编码区进行了测序。

结果:从1月2020年到12月20日,总共测序了340个Covid-19病毒。S蛋白质的氨基酸44(12.9%)与参考序列WIV04(GenBank加入Mn996528)相同。对于剩余的296序列(87.1%),发现共43种非同义替代模式。发现的非同义替换,其中一些仅在特定的时间间隔检测到,然后它们消失。

结论:持续的遗传监测系统很重要。它将有助于早期检测可以增加感染性以及选择病毒以逃避免疫抑制的突变本文受版权保护的突变。版权所有。

PMID:33951208.|DOI:10.1002 / JMV.27063